Pěkný zápisek. Pouze dodám, že pokud instalujete do /opt, nemusíte dělat symlinky, ale stačí pouze upravit onu proměnnou PATH, podobně jako to děláte s ld.so.conf. Pár desítek adresářů v /opt to tímto způsobem snese, ale rozhodně bych to nedoporučil pro každý balíček. Další nuance je pak používat při další kompilaci --with-něco=/opt/něco. Systém založený na vlastnictví souborů bych označil za trochu obskurní, možná by to šlo ale mnohem elegantněji řešit pomocí rozšířených atributů.
Jak přesně tvoříte ty balíčky? Instalujete do pomocného adresáře, tam pak vyrobíte balíček, a ten nainstalujete do systému?
